9月24日，“长江杯”2026全球AI蛋白质设计挑战赛正式启动。大赛在上海市经济和信息化委员会、上海市科学技术委员会指导下，由上海交通大学、上海人工智能实验室、临港实验室、昌平实验室、香港中文大学、浙江大学、上海科学智能研究院、未来启点社区共同发起并主办，上海交通大学自然科学研究院承办，北京大学化学与分子工程学院、清华大学化学工程系、中国科学技术大学生命科学与医学部、复旦大学智能复杂体系实验室、西湖大学工学院、国家超级计算广州中心、上海仪电集团、科学智能战略科技力量联盟协办。
蛋白质承担着催化、识别、信号传递等大量生命功能，其性能很大程度上由氨基酸序列决定。一条仅100个氨基酸组成的蛋白质，理论上的序列组合就高达 20的100次方种，靠传统设计方法难以完成，AI能够从海量数据中学习序列、结构与功能规律，更快找到有潜力的候选设计。但计算结果并不是AI蛋白质设计的终点。一个由AI设计出的蛋白质，能否真正被合成、稳定表达并实现预期功能，最终仍要走进实验室接受检验。
基于此，本届大赛以真实科学问题为牵引，将大规模湿实验验证引入赛事核心环节，通过统一赛题、标准化实验和真实数据评价，让来自全球不同团队、不同模型和不同技术路线的设计在同一实验体系下接受检验。
围绕这一目标，赛事将设置多个蛋白质设计靶点，聚焦纳米抗体（nanobody/VHH）或迷你结合蛋白（minibinder）的从头设计。VHH 可以理解成“抗体的最小作战单元”，分子量只有常规抗体的十分之一左右，在药物与诊断领域具有广泛应用价值；minibinder 则更像是从零设计出来的蛋白质，代表了当前从头设计蛋白质的重要方向，体现 AI 从零生成自然界不存在的全新蛋白质的能力。
在AI完成从头设计后，组委会将对经过统一、标准化流程筛选后的不少于5000个候选蛋白免费开展湿实验验证，包含表达、纯化、检测步骤，以真实实验结果作为评价设计性能和产生优胜团队的重要依据，并沉淀真实实验数据，为不同算法和模型的横向比较、持续迭代以及AI蛋白质设计Benchmark建设提供基础，探索从“AI设计”走向“自动化实验验证”的科研闭环。
大赛面向全球高校、科研院所、企业及跨学科创新团队开放，鼓励人工智能、计算生物学、结构生物学、蛋白质工程等不同领域的科研人员跨学科协作，并设置总额100万元人民币的赛事奖金，希望通过开放竞赛汇聚全球AI for Science创新力量，让更多算法真正走进实验室，也让真实实验数据重新进入模型研究与方法迭代之中。
从多所高校、实验室和科研机构共同参与，到数千个候选蛋白接受统一实验验证，本届赛事希望以真实科学问题为纽带，汇聚AI、生命科学、工程与实验平台等多方力量，探索形成跨机构、跨学科、跨领域协同攻关的新型科研组织方式。通过持续沉淀真实实验数据、评价体系和开放Benchmark，赛事有望进一步夯实我国AI for Science领域的科研基础能力，为原创算法验证、青年人才培养和前沿技术突破提供长期支撑。联系邮箱：zbztzhz@sjtu.edu.cn